Innehåll
Proteiner bildas från polymer- eller aminosyrakedjor. Aminosyrasekvensen (tillsammans med några modifieringar) bestämmer vilken proteinstruktur den kommer att anta. Proteiner har fyra strukturnivåer: primär, sekundär, tertiär och kvaternär. Den primära strukturen är endast aminosyrasekvensen, medan den sekundära strukturen avser 3-D-strukturen antagen av segment av aminosyrakedjan.
Alpha-helix
En alfa-helix är en mycket vanlig typ av sekundär struktur där kedjan av aminosyror vrider för att bilda en delikat spole. Kvävet i petidbindningen i varje aminosyra har en väte bunden till den, så att den kan bilda en typ av interaktion som kallas en vätebindning med syreatomen i karbonylgruppen i varje bindning. Vätebindningar håller propellern ihop och hjälper den att behålla sin form.
Sidokedjor
Alla aminosyrasidokedjor i en alfa-helix pekar utåt, vilket gör en komplett slinga varje 3,6 aminosyror. Propellern är vridet medurs, så det beskrivs ibland som "rätt". Ett protein kan innehålla flera alfa-helixer, och vissa proteiner som keratin (proteinet som finns i hår och naglar) har denna typ av struktur över det mesta av deras längd.
Beta lakan
Ett beta-ark hålls också ihop av vätebindningar, men i detta fall placeras två regioner av polypeptiden sida vid sida, och vätebindningarna håller dem ihop i ett slags pläterat pappersark. De parade trådarna kan antingen rotera i motsatta riktningar, i vilket fall de är antiparallella, eller de kan vara parallella, med båda strängarna som delar samma riktning. Det antiparallella arrangemanget är vanligare. Aminosyrasidokedjorna alternativt pekar upp och ner, vinkelrätt mot arkets plan.
överväganden
Polypeptiderna kan innefatta flera beta-skivor och alfa-helixportionerna som delar av deras totala 3-D-struktur eller den tertiära strukturen. En enda polypeptid kan vara ett protein ensam eller flera kan binda till att bilda ett protein. Om flera polypeptider är inblandade kallas deras rumsarrangemang en kvaternär struktur. Den sekundära strukturen hänvisar specifikt till egenskaperna hos alfa-helixen och betaplanet. Som den tertiära och kvaternära strukturen kan den sekundära strukturen bli oordning eller denaturerad genom applicering av höga temperaturer och / eller signifikanta förändringar i pH.