Innehåll
Peptider är fragment av korta polymerer som består av aminosyror. Varje peptid har en viss sekvens av aminosyror betecknade med en trebokstavskod eller bara en; exempelvis förkortas aminosyran alanin som "Ala" eller "A". Belastningen av peptider i lösningen beror på dess surhet. Den isoelektriska punkten (pl) avser surhetsvärdet för lösningen i vilken peptidmolekylen har en nettoladdning lika med noll. Lösligheten för peptiden är minimal vid den isoelektriska punkten. Använd tillgängliga webbservrar för att beräkna pI-värdet för en peptids aminosyrasekvens.
Steg 1
Sekvensera peptiden med enbokstavskoden. Till exempel, om en peptid har en aminosyrasekvens Ala-Ser-Glu-Leu-Pro (Alanin - Serin - Glutaminsyra - Leucin - Proline), skulle sekvensen med en bokstav vara "ASELP". Om nödvändigt hänvisas till konverteringstabellen med en bokstav till tre bokstäver i avsnittet Resurser.
Steg 2
Använd vilken webbläsare som helst som Internet Explorer eller Firefox för att ange en server som beräknar en peptids (pI) isoelektriska punkt; se Resurser.
Steg 3
Skriv en bokstavssekvens för peptiden - i vårt exempel "ASELP" - i rutan och klicka på "Beräkna".
Steg 4
Läs värdet av den isoelektriska punkten (pI) som ges i raden "Teoretisk pI / Mw" (teoretisk pl). I vårt exempel är pI 4,00. Observera att servern också beräknar peptidens molekylvikt (Mw).